1. La Asamblea General: es el cuerpo supremo de la AU y podrá tomar cualquier decisión siempre que con ello no se oponga a la Constitución Nacional, a las leyes panameñas o al propio estatuto de la Asociación.
2. La Junta Directiva: está conformada por 14 miembros. El presidente anterior y 13 miembros elegidos cada año por votación. Este organismo tiene el control y la dirección plena de las actividad de la Asociación, salvo la que la ley y los estatutos reserva a la Asamblea General.

Diagrama del Organigrama de la AU